Né à Ried (Autriche), Johannes Meissl a étudié à l'université de musique et des arts du spectacle de Vienne (mdw) avec Wolfgang Schneiderhan, Gerhart Hetzel et Hatto Beyerle. Il obtient son diplôme avec distinction et un prix spécial du ministère. En 1982, il rejoint le quatuor Artis. Après des études complémentaires avec le Quatuor LaSalle aux États-Unis et plusieurs prix de concours, l'ensemble a entamé une carrière internationale, se produisant toujours avec la même formation. Des concerts dans des séries et festivals prestigieux du monde entier, des récompenses pour plus de 40 enregistrements (Grand Prix du Disque, Diapason d'Or, Echo, Midem Classics) et la « Artis Series » dans le cadre du programme annuel officiel de la Gesellschaft der Musikfreunde au Musikverein de Vienne (en cours depuis 1988) témoignent de la réputation internationale de l'ensemble. 
 

Meissl se produit également en récital solo et dans le cadre de projets ouverts de musique de chambre, et il a connu le succès en tant que chef d'orchestre. 

Depuis 1992, Meissl enseigne au mdw, et depuis 2004 en tant que professeur universitaire de musique de chambre. Depuis octobre 2019, M. Meissl est vice-recteur chargé des affaires internationales et des arts de cette université de premier plan. Auparavant, il a dirigé le département de musique de chambre Joseph Haydn de la mdw et a été président du Sénat de la mdw. 
 

M. Meissl est directeur artistique de l'ISA - International Summer Academy of mdw et codirecteur artistique de l'ECMA (European Chamber Music Academy). Il donne des cours de maître dans le monde entier et est très actif dans le cadre du projet Musethica, qui associe une formation intensive à l'interprétation à une action sociale et à un engagement communautaire. 

Depuis plus de 30 ans, M. Meissl est un professeur influent et un mentor pour des générations de jeunes musiciens de chambre et d'ensembles.

Ses élèves ont remporté les premiers prix lors de grands concours internationaux et ont réussi à établir des carrières durables. Pour un certain nombre d'enregistrements acclamés de ses anciens élèves (Midem Classics, Echo, etc.), il a également joué le rôle de producteur artistique.